定义不同
胶原蛋白是一类蛋白质家族。目前为止，已至少发现了30余种胶原蛋白链的编码基因，可以形成16种以上胶原蛋白分子。根据它们在体内的分布和功能特点，可以将胶原分成间质胶原、基底膜胶原和细胞外周胶原。间质型胶原蛋白分子占整个机体胶原的绝大部分，包括Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型胶原蛋白分子，Ⅰ型胶原蛋白主要分布于皮肤、肌腱等组织，也是水产品(皮、骨和鳞)含量最多的蛋白质，占全部胶原蛋白含量的80-90%左右，在医学上的应用最为广泛。
胶原蛋白肽是一种透明的胶原蛋白提取物，由两个或两个以上的氨基酸组成。肽的分子量、氨基酸排列顺序不同，所表现的功能也就不同。一般认为，肽是精准的蛋白质片段，其分子只有纳米级般大小，肠胃、血管及肌肤皆易吸收。
肽是由两个或两个以上的氨基酸以肽键相连的化合物，是介于氨基酸和蛋白质的中间物质，是蛋白质的功能片段和结构片段，是蛋白质的活性基因部分，是生命的营养物质和基础物质。
吸收率不同
胶原蛋白是一种纤维性硬蛋白，为结缔组织的主要蛋白，是人体中最多的一类蛋白质。相对分子量高达30万道尔顿，人体食用后不能直接吸收，需要经过消化分解为小分子肽或者是游离氨基酸以后才能够被人体吸收，进而发挥功效，在这种转化过程中，吸收率非常低。
胶原蛋白肽则是胶原蛋白经过人工蛋白酶处理以后而形成的小分子肽，相对分子量为几百至几千，人体在食用后能够被直接有效的吸收利用，吸收率可高达90%甚至更高，相较于胶原蛋白，具有更好的效果。
功效不同
补充胶原蛋白肽更能改善肌肤干燥、粗糙、松弛、皱纹、毛孔粗大、暗淡、色斑等衰老现象。另外胶原蛋白肽可促进骨的形成，增强低钙水平下的骨胶原结构，从而提高了骨强度，即达到了预防骨质疏松症的作用，有研究表明补充胶原肽3周的时间有助于抑制骨密度的下降，缓解关节软骨的老化。
胶原蛋白常存在于动物结缔组织中，主要的功效为润泽发质、养颜护肤。适当食用富含胶原蛋白的食物，可以维持头发的营养，使得头发更加柔软有光泽。其次胶原蛋白可以达到滋润肌肤的作用，能够维持肌肤的弹性。
