1
给药方式不同
1、注射型流感病毒为灭活疫苗
注射型流感病毒疫苗通过非优势臂上臂外侧三角肌肌内注射，接种部位的疫苗抗原成分引发机体免疫应答过程，最终形成有效的流感病毒特异性免疫记忆。
2、冻干-鼻喷式流感病毒为减毒活疫苗
鼻喷式疫苗在接种时则要使用稀释剂将冻干粉末状的疫苗抗原成分液化，然后吸入注射器，装上雾化喷头，对准鼻腔喷雾，使其覆盖到鼻腔粘膜。这个时候流感疫苗减毒活病毒已经很好的附着在鼻腔内粘膜上，已经减毒的流感病毒作为外来抗原刺激鼻咽相关淋巴组织(NALT)产生粘膜免疫应答并形成免疫记忆，这样就构筑了流感病毒再次入侵鼻咽粘膜时的第一道防线。
2
生产工艺不同
减毒活疫苗是将病原微生物(细菌或病毒)在人工培育的条件下，促使产生定向变异，使其极大程度地丧失致病性，但仍保留一定的剩余毒力、免疫原性及繁殖能力，制成疫苗接种人体后，令机体产生一次亚临床感染而获得免疫力。
灭活裂解疫苗是采用化学或物理方法，使得病原体完全丧失对原来靶器官的致病力，但是保留了相应抗原的免疫原性。
3
可能产生的不良反应不同
1、注射型流感病毒灭活疫苗
常见的不良反应是注射部位的触痛、瘙痒，一过性的发热，这些反应短期内会自行消失，并不需要做特殊的处理。
2、鼻喷式流感病毒减毒活疫苗
其常见不良反应则是出现感冒样的流涕和鼻塞。并不会对接种部位造成接触性伤害。
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