中药治疗
中医治疗肾囊肿的效果最佳，目前在中医治疗方面采用保守治疗，尤其以微化中药渗透疗法效果显着，该疗法的中药活性物质促使囊壁上的血液循环与通透性发生质的改变，从而使得囊内液不断回收，不断减少，直至不再分泌。
1、中医治疗肾囊肿湿热蕴肾证
肢体浮肿，小便不利，灼热刺痛。色黄或红，腰背胀痛，口腻纳呆，渴不欲饮，身胀困重，舌红，苔黄腻，脉濡数。清热化湿。
代表方
四苓散、八正散、小蓟饮子加减。
2、脾肾阳虚水停证
浮肿明显，面色苍白，畏寒肢冷，腰腿酸软，神疲乏力，纳呆或便溏，小便短少或清长，少腹可荆及水囊样包块，舌嫩淡胖，苔白滑，脉沉细，或沉迟无力，温补脾肾，利水消肿。
代表方
附子理中汤合真武汤加减。
3、中医治疗肾囊肿肾虚血瘀水聚证
肢体浮肿，小便短少，腰膝酸软，耳鸣，口唇色暗，眼眶发黑，指甲紫暗，腰胀痛或刺痛，小腹包块有压痛，舌淡暗，脉细涩。补肾利水，活血化瘀。
代表方
右归饮合少腹逐瘀汤，五苓散加减。
4、中医治疗肾囊肿肾虚火旺证
小便短赤带血，头晕耳鸣，神疲，颧红潮热，口干咽燥，腰膝酸软，舌质红，脉细数。滋阴降火，凉血止血。
代表方
知柏地黄汤合小蓟饮子加减。
5、针刺治疗
肝俞、脾俞、肾俞、志宝、飞扬、太溪;膻中、鸠尾、中脘、肩俞、气海、复溜、三阴交。每次3～4穴，依据证之虚实而采用补泻手法，留针20～30分钟，或用灸法，2组穴位交替进行。
一般治疗
对于肾囊肿的治疗，一定要选择正确的治疗方法，对症治疗。一般情况下，病人检查出多囊肾后，首先要保持乐观的心态，如果尚未对病人正常生活造成影响的，平时需注意不要或少吃吃过咸、辣等刺激性的食物，作息时间要规律，情绪要平稳乐观。
患者在治疗肾囊肿的过程中要早发现、早治疗。越早治疗越好，因为肾囊肿会发展成为肾衰竭，那就不好了。
手术治疗肾囊肿
手术治疗方法是治疗肾囊肿的一种有效方法，一般会采用囊肿去顶减压术。此手术减轻了囊肿对肾实质的压迫，保护了大多数剩余肾单位免遭挤压和进一步损害，使肾缺血状况有所改善，部分肾功能单位得到恢复，延缓了疾病的发展。手术成功的关键是尽可能早施行手术，囊肿减压必须彻底，不放弃小囊肿和深层囊肿的减压。
