颜色不同
果果实每年10～11月成熟，当鲜果由鲜红转为紫红色，种仁表面由白色变为棕褐色，草果外形呈椭圆形或长圆形，表面有明显的纵沟纹，顶端有一个圆形突起，尾部附有节果柄，表皮颜色为灰棕色或者褐色。
草寇又称草豆蔻、草蔻仁、海南山姜，为豆蔻中的一员，也是多年生姜科草本植物的果实，每年8～11月成熟。果实呈不规则球形团子，外壳有些像圆形的小核桃，表面布满了深浅不一的似龟裂般的小裂缝，晒干后呈灰棕色或者褐黄色。
功效不同
草果为药食两用植物，其中食用香料量大于药用量。草果含挥发油约3%～4%，挥发油中的反-S-烯醛物质为草果的主要辛香成分。除此之外还含有桉油素、麝子油醇、樟脑、山姜素、肉桂酸甲酯、橙花叔醇、芳樟醇、香叶醇、草果酮、莳萝艾菊酮、乙酸龙脑脂、豆蔻素等物质。草果辛香气浓烈，微回甘，有辛辣味，在烹饪中具有增香除膻祛异、防腐抗氧化剂作用。
草寇作为中药材运用十分广阔，具有祛寒止吐、健胃消食、消除口气的作用，它在卤水中亦表现优良。其种子含有挥发性油，其主要成分为桉叶素和金合欢醇，另外还有山姜素、乔松素、小豆蔻素等，草寇气味比较复杂，香、辛辣、酸、凉香、微苦等多种味道集一身。 在烹饪中具有增香脱骨、除膻味异怪的功效。
使用方法不同
草果算是在卤水中非常多见的香料之一，辛香开胃，可以祛腥除异之外，对于卤水中的香味还起到了承前启后、固守中庸的作用。常见的用法就是将草果拍散，然后用酒浸泡一会去掉那个好像烟熏一样的味道，然后就可以使用了，如果卤的食材味道比较轻，可以考虑将草果里面的籽去掉再用。
草蔻在卤水中也非常适用，同样可以去腥除异， 跟草果的效果有点相近，但是据一些做卤水的朋友说，如果食材中包含骨骼部分的话，用草蔻更能激发“脱骨香”。而且一些麻辣口味的卤水，也可以用草蔻和荜菝的组合搭配，让卤水口感更好、入味更优。
